Работа посвящена исследованию системы организации реализации функций в сфере высшего образования государственными органами на основе анализа законодательных и иных нормативных правовых актов, регламентирующих их правовой статус, как на общероссийском, так и на ведомственном (отраслевом) уровнях. Автор приходит к выводу о недостаточной упорядоченности и пробелах в правовом закреплении государственных функций за соответствующими органами исполнительной власти, осуществляющими государственное управление высшим образованием. Отмечается практически полное отсутствие правового закрепления соответствующих функций, выполняемых исполнительными органами по управлению подведомственными отраслевыми системами высшего образования. Автором предложена новая модель системы реализации государственных функций в сфере высшего образования, а также определены направления совершенствования законодательства об образовании и оптимизации правового регулирования деятельности федеральных исполнительных органов, управляющих высшим образованием.