В статье рассматриваются проблемные вопросы при осуществлении государственного финансового контроля за расходованием бюджетных средств, выделяемых на реализацию приоритетных государственных программ и национальных проектов. Предлагаются способы повышения эффективности контрольной деятельности путем установления механизмов взаимодействия контрольных (надзорных) органов, взаимного признания результатов контрольных (надзорных) мероприятий.