Вопросы обеспечения экономического суверенитета Российской Федерации — одни из самых рассматриваемых в последние годы. Не обойдены вниманием и таможенные органы страны, непосредственно участвующие в этом процессе. Вместе с этим отдельные узловые проблемы в их деятельности достаточного освещения не получили. В статье анализируются некоторые из них. Показываются меры нормативно-правового и организационно-управленческого характера, сложность и противоречивость как самого процесса укрепления таможенной системы, так и деятельности ее структур в условиях перехода страны к рыночной экономике.