На основе анализа законодательства, доктринальных источников и судебной практики рассмотрения арбитражных споров в статье исследуются вопросы оплаты стоимости производства назначенной по делу экспертизы. При этом обращается внимание на многочисленные проблемы, возникающие в правоприменении, — коллизионность и неопределенность ситуаций отказа от выплаты вознаграждения экспертам, обусловленных «дефектами» заключения эксперта. Поднимаются вопросы унификации соответствующей судебной практики и повышения качества судебно-экспертной деятельности.