В научной статье рассмотрены проблемы межведомственного взаимодействия органов опеки и попечительства с учреждениями (организациями) для детей-сирот и ведомств различной направленности, чья деятельность связана с деятельностью подобных учреждений. Все чаще звучат предложения о реформировании органов опеки и учреждений для детей-сирот путем приведения их к единой модели подчиненности. Подобные предложения, а также случаи халатного отношения сотрудников учреждений и органов опеки, послужившие поводом для широкого общественного резонанса, явились началом глобального процесса перестройки системы защиты детства в нашем государстве. Ввиду проводимой в России политики в указанной сфере деинституционализации как части реформирования данных учреждений, автор раскрывает имеющиеся проблемы межведомственного взаимодействия; отдельно выделяет роль органов опеки и попечительства, предлагает возможные варианты разрешения некоторых проблем путем внесения изменений в законодательство субъектов РФ.