В настоящее время существенную долю расходов федерального бюджета составляют субсидии, предоставление которых опосредуется бюджетно-правовым договором. В практике применения данного правового средства обнаруживается множество проблем, негативно влияющих на бюджетную деятельность публично-правовых образований. Однако вопросы договорного регулирования бюджетных отношений по предоставлению субсидий недостаточно исследованы в научной литературе. Целью настоящей работы является идентификация на основе анализа судебной практики правовых проблем, возникающих в рамках механизма договорного регулирования данных отношений, и предложение мер по его совершенствованию.