Целью статьи является анализ современных теоретико-методологических подходов к пониманию административной юрисдикции таможенных органов. В качестве методов исследования в статье были использованы методы анализа и синтеза, классификации и систематизации, метод анализа научной литературы, а также формально-юридический метод. В качестве основных научных результатов статьи стали положения о возможности выделения нескольких вариантов научного понимания административной юрисдикции: 1) деятельность; 2) научная категория; 3) компетенция; 4) методологический подход применительно к административно-процессуальной деятельности; 5) административно-правовой институт. Подчеркнут вклад Д.Н. Бахраха, О.В. Гречкиной в развитие теории административной юрисдикции таможенных органов. Выделены особенности этой теории, среди которых: развитие теории процессуальных правоотношений применительно к таможенным органам и отграничение от судебной юрисдикции; признание конфликта главным источником административно-юрисдикционных правоотношений; выделение форм административной юрисдикции таможенных органов; рассмотрение последней в контексте систем более высокого свойства (система таможенного регулирования, и др.). Сделаны выводы о том, что ведомственные аспекты административной юрисдикции способны дополнять общую теорию административной юрисдикции, а теория административной юрисдикции таможенных органов будет развиваться в направлении понимания юрисдикции в контексте содержания компетенции и усиления в ней правозащитного потенциала.