Статья посвящена выявлению содержания понятия «структура системы административно-правового обеспечения инновационной деятельности» на основе философского понимания структуры и ее соотношения с системой и ее элементами. Актуальность статьи обусловлена тем, что в современных условиях разработка и внедрение инноваций представляют собой один из определяющих факторов ускорения научно-технологического развития и повышения экономического потенциала страны. Большое значение при этом имеет надлежащая организация государственного управления и административно-правового регулирования в области инновационной деятельности, для которых важность представляют системность и структурированность. Автором обращено внимание на сложившиеся к настоящему времени подходы к определению понятия структуры, зависимость ее свойств от видов систем, характерное для нее качество единства устойчивости и изменчивости. На основе сопоставления данной категории с явлениями государственно-управленческой действительности обосновываются суждения о наличии инвариантных элементов в системе административно-правового обеспечения инновационной деятельности и их изменчивости при выделении внутри них дробных звеньев, чем в совокупности определяется эффективность функционирования соответствующей системы. Автор приходит к выводу о необходимости понимания структуры системы административно-правового обеспечения инновационной деятельности в качестве основанного на единстве устойчивости и изменчивости концептуального способа построения и организации взаимосвязи элементов системы административно-правового обеспечения инновационной деятельности.