Статья посвящена вопросу соотношения правовых режимов Байкальской природной территории и других видов территорий и зон, созданных в ее границах, в частности туристско-рекреационных особых экономических зон. Указывается на отсутствие прямых норм, запрещающих создание определенных видов территорий и зон в границах Байкальской природной территории. Единственным критерием являются прямые запреты и ограничения на осуществление определенного вида природопользования, оказывающего негативное воздействие на окружающую среду, или вида хозяйственной деятельности в границах Байкальской природной территории. Отмечается отсутствие в законодательстве системного регулирования порядка выбора земельных участков, которые могут быть включены в особые экономические зоны, что делает риски причинения вреда окружающей среде для Байкальской природной территории особо высокими. В целях гармонизации законодательства об охране озера Байкал и других видах зон и территорий предлагается ряд нововведений в соответствующие правовые акты.