В статье рассмотрена проблема правового регулирования и применения на практике института досудебного соглашения о сотрудничестве по уголовным делам о преступлениях в финансово-бюджетной сфере на примере злоупотребления полномочиями и злоупотребления полномочиями при выполнении государственного оборонного заказа. Установлено, что относительно редкое применение соглашения о сотрудничестве при расследовании уголовных дел о таких преступлениях в значительной степени обусловлено недостатками в законодательном регулировании данного института, в том числе в части регламентации оснований для заключения соглашения о сотрудничестве и об отказе в этом, а также определенного короткого срока для принятия соответствующего решения прокурором.