В статье исследуются особенности осуществления государственного контроля (надзора) в сфере инновационной деятельности в промышленности в условиях перехода к технологической автономии. Анализируются теоретические подходы к соотношению понятий «контроль» и «надзор», выявляются пробелы законодательного регулирования. Раскрываются системные проблемы, связанные с межведомственной разобщенностью, избыточной формализацией требований и низким качеством экспертизы промышленной безопасности. Обосновывается необходимость создания межведомственного координационного механизма на базе цифровой платформы «ГосТех» с пилотным внедрением предложенной модели.