В статье рассматриваются отдельные вопросы правового регулирования предпринимательской и иной хозяйственной деятельности некоммерческих организаций в России. В условиях рыночной системы хозяйствования некоммерческим юридическим лицам предоставляются ограниченные возможности осуществления предпринимательской и иной приносящей доход деятельности, при этом в современном гражданском законодательстве отсутствует единая концепция правовой регламентации таких видов хозяйственной деятельности, что создает дискуссию в научной литературе и проблемы при правоприменении. В статье затрагиваются проблемы соотношения предпринимательской и приносящей доход деятельности некоммерческих организаций. Исследуется специальное законодательство о некоммерческих организациях, его соотношение с положениями Гражданского кодекса РФ. Указывается на проблему наделения обособленных подразделений некоммерческих организаций правом оперативного управления. В результате проведенного исследования автором предложены механизмы совершенствования действующего российского законодательства о некоммерческих организациях.