Анализ выявленных теоретических и практических противоречий в правовом и организационном регулировании инноваций показал наличие последствий, негативно отражающихся на публичных и частных интересах. Предлагаемые в статье законодательные и организационные изменения призваны способствовать достижению добросовестной конкуренции, балансу частных и публичных интересов. В работе показана важность защиты личных неимущественных прав автора как основы для защиты исключительных прав правообладателей, предложены меры по их обеспечению и формы участия автора наравне с другими субъектами по созданию и реализации инноваций. Выделены направления развития государственной политики по совершенствованию инновационного механизма.