Статья посвящена вопросам организации и осуществления со стороны государства контроля над финансовохозяйственной деятельностью некоммерческих организаций в Российской Федерации. В статье ставится проблема определения публично-правового статуса и публично-правовой природы финансовой деятельности некоммерческих организаций в части реализации ими своих целей и задач. В статье исследуются источники финансирования деятельности некоммерческих организаций, такие как бюджетные субсидии, а также иные внебюджетные источники, получаемые на реализацию целей и задач некоммерческой организации. Также в статье исследуются полномочия органов исполнительной власти по контролю за деятельностью некоммерческих организаций в части реализации ими финансово-хозяйственной деятельности. В статье делается вывод, что контроль и надзор за деятельностью некоммерческих организаций в России, в том числе за их финансово-хозяйственной деятельностью, имеют свои существенные отличия от контроля за бюджетными организациями как в части определения целей и задач проверок, так и в сфере организации такого контроля, что требует, по мнению автора, специального законодательного определения порядка осуществления такого контроля.