Статья посвящена анализу основных проблем, связанных с таможенными операциями товаров, которые перемещаются на основании договора транспортной экспедиции. На основании анализа статистических данных международные торговые отношения в Российской Федерации на сегодняшний день переходят на новый вектор развития — это страны Азиатско-Тихоокеанского региона. Оптимизация торговых, транспортных отношений привели к развитию института транспортной логистики, организации, осуществляющие экспедирования, перевозку, логистические услуги в целом стремятся к развитию себя как профессиональных участников рынка, на основании этого был проведен анализ и представлены выводы о возможных проблемах при прохождении таможенного контроля товаров, перемещаемых в рамках договора международной транспортной экспедиции.