В данной статье анализируются современные аспекты международного сотрудничества ФТС России в рамках ЕАЭС. Автором выявлены сдерживающие факторы взаимодействия таможенных органов стран Евразийского экономического союза. Рассмотрены различие в косвенном регулировании потока товаров между странами — участницами ЕАЭС. Подчеркивается необходимость укрепления экономик стран — членов Союза, а также сокращения разрыва между уровнями экономического развития различных регионов.