Контрольно-надзорная деятельность территориальных органов Министерства юстиции Российской Федерации свидетельствует о пренебрежительном отношении некоммерческих организаций к установленным обязательным требованиям законодательства, что способствует увеличению количества нарушений с их стороны. В статье исследована практическая деятельность территориальных органов Министерства юстиции Российской Федерации с целью выявления причин и условий, способствующих такому увеличению. Использованы общенаучные методы исследования, которые позволили проанализировать причины, способствующие нарушению обязательных требований, установленных в отношении некоммерческих организаций. На основании проведенного анализа выявлены проблемы, с которыми сталкивается государственный орган, уполномоченный на проведение государственного контроля (надзора) за деятельностью некоммерческих организаций. Предложены пути решения проблем и устранения причин, способствующих совершению нарушений со стороны некоммерческих организаций.