Предлагаемая статья посвящена практическим вопросам применения риск-ориентированного подхода при контроле таможенной стоимости товаров. В статье исследована система управления рисками в соответствии в ТК ЕАЭС, проведено исследование применения риск-ориентированного подхода при контроле таможенной стоимости товаров. В работе рассмотрены блокирующие критерии отнесения участников ВЭД к категории низкого уровня риска, определены отрицательные критерии оценки деятельности декларантов, показатели, которые подлежат мониторингу и анализу в отношении деятельности уполномоченных экономических операторов (УЭО), 17 показателей, по которым таможенные органы проводят мониторинг и анализ деятельности УЭО для выявления рисков нарушения таможенного законодательства и свидетельств возможного несоблюдения условий присвоения статуса УЭО и положений соглашения между таможенными органами и УЭО. В результате исследования выявлено, что подавляющее большинство участников ВЭД определено к категории среднего уровня риска: их доля варьируется на уровне 81–84%, к категории низкого уровня риска — 11–12% (показатель улучшился за 2017–2022 гг. в два раза), к высокому риску относится 4–8% от общего объема участников. Предложены направления трансформирования системы оценки деятельности таможенных органов: определение премиальной части заработной платы сотрудников таможенных органов исходя не только из объема начисленных таможенных платежей, но и из объема возвращенных; определение премиальной части не по объему начисленных таможенных платежей, а по объему зарегистрированных таможенных деклараций, по объему участников ВЭД, администрируемых в конкретном таможенном органе, по количеству выявленных нарушений, которые не оспариваются участниками ВЭД в суде, и т.п.