Статья посвящена проблемам эффективности функционирования преференциального налогового режима в особых экономических зонах (ОЭЗ). Авторский аналитический обзор действующих в России ОЭЗ позволяет систематизировать их особенности, осуществить сравнительный анализ налоговых условий резидентов ОЭЗ, выявить преимущества и существующие проблемы, оценить эффективность деятельности ОЭЗ по ряду показателей. Даны рекомендации по совершенствованию налоговых инструментов, направленных как на развитие, так и качественное администрирование деятельности ОЭЗ.