В статье на основании результатов обобщения научных точек зрения, анализа содержания действующего законодательства и правоприменительной практики обозначены основные трудности в сфере применения альтернатив уголовному преследованию, основанных на действии принципа презумпции невиновности, и сформулированы предложения по их преодолению.