История журнала «Эксперт-криминалист» началась в 2005 г. с № 0, с 2006 г. журнал выходит ежеквартально. Первым главным редактором стал представитель ЭКЦ МВД России Эдуард Молоков. Ему удалось привлечь внимание к новому изданию, но обеспечить стабильную работу за счет притока надлежащего качества статей не получилось. Когда в начале 2010 г. автора статьи пригласили занять вакантный пост главного редактора, портфель журнала был наполовину пуст, а оформление имевшихся в резерве статей, мягко говоря, оставляло желать лучшего.

За прошедшие годы командой Издательской группы «Юрист» была проделана большая работа, направленная на придание журналу статуса одного из ведущих изданий по теоретико-правовым вопросам использования специальных знаний в судопроизводстве и научно-прикладным проблемам проведения отдельных видов экспертиз.

Так, в № 3 журнала за 2010 г. появилась рубрика «Дом, в котором мы живем…», в короткий срок получившая признание авторов и читателей. Первыми о «своем доме», идеях и наработках рассказали сотрудники кафедры криминалистики Омской академии МВД России. Затем были опубликованы труды представителей Института судебных экспертиз МГЮА имени О.Е. Кутафина; кафедры криминалистики Института права Башкирского государственного университета; Российского федерального центра судебной экспертизы при Минюсте России; НП «Палата судебных экспертов»; кафедры криминалистики Саратовской государственной юридической академии; НИИ криминалистики Московской академии Следственного комитета Российской Федерации; кафедры судебных экспертиз и криминалистики Российского государственного университета правосудия; кафедры уголовного процесса и криминалистики юридического факультета Южного федерального университета; Восточно-Сибирского института МВД России; управления научно-исследовательской деятельности (НИИ криминалистики) Главного управления криминалистики (Криминалистического центра) Следственного комитета Российской Федерации; кафедры уголовного процесса и криминалистики Института права Волгоградского государственного университета; кафедры криминалистики, судебных экспертиз и юридической психологии Байкальского государственного университета; кафедры криминалистики Московского государственного университета имени М.В. Ломоносова; Российского центра судебно-медицинской экспертизы и других государственных судебно-медицинских экспертных учреждений России. В № 3 за 2024 г. вышли статьи сотрудников кафедры судебной экспертизы и криминалистики Центрального филиала Российского государственного университета правосудия.

В 2011 г. был сформирован редакционный совет журнала. Отдавая дань уважения таланту и авторитету каждого известного специалиста в области теории и практики судебно-экспертной деятельности, к работе в его составе было решено привлечь руководителей государственных судебно-экспертных учреждений и ведомственных экспертных подразделений — Экспертно-криминалистического центра МВД России, Российского федерального центра судебной экспертизы при Минюсте России, Российского центра судебно-медицинской экспертизы Минздравсоцразвития России, 111 Главного государственного центра судебно-медицинских и криминалистических экспертиз Минобороны России, экспертно-криминалистического управления Департамента специального и криминалистического обеспечения ФСКН России, Центрального экспертно-криминалистического таможенного управления ФТС России, а также Главного управления криминалистики и управления организации экспертно-криминалистической деятельности Следственного комитета Российской Федерации. Это способствовало росту публикационной активности авторов, имеющих опыт производства судебных экспертиз, позволило поддержать интерес к журналу со стороны практических работников.

1 декабря 2015 г. (за № 1412 по шифру 12.00.00 — Юридические науки) журнал «Эксперт-криминалист» вошел в Перечень рецензируемых научных изданий, в которых должны быть опубликованы основные научные результаты диссертаций на соискание ученой степени кандидата и доктора наук, формируемый Минобрнауки России (на основании рекомендаций Высшей аттестационной комиссии) по научным специальностям и соответствующим им отраслям науки, по которым присуждаются ученые степени, предусмотренным номенклатурой научных специальностей. При этом удалось сохранить практико-ориентированную концепцию журнала. Как и 20 лет назад, сегодня для главного редактора и редакционного совета приоритетом является публикация статей авторов, которые предлагают оригинальные способы решения задач, возникающих при производстве конкретных видов экспертиз.