При заключении корпоративного договора принцип свободы договора проявляется наиболее ярко, поскольку в нормах о корпоративном договоре его содержание не конкретизировано в той степени, о которой можно говорить относительно более классических обязательственно-правовых договоров. Данное обстоятельство в первую очередь связано с тем, что корпоративный договор может совмещать в себе условия, характерные для разных поименованных в законе договоров, позволяющие оценить их как особую характеристику такого договора. Именно поэтому в гражданском праве корпоративный договор понимают как смешанный. Следует заметить, что в российском гражданском праве существуют и альтернативные точки зрения. В связи с этим возникает вопрос о соотношении диспозитивных и императивных начал в регулировании корпоративных отношений.

Проблематика моделирования корпоративных отношений в рамках презумпции свободы договора характерна и для гражданского законодательства Казахстана, где корпоративные отношения пока не нашли законодательного закрепления. Исследователи становления корпоративных отношений в Республике Беларусь также предполагают, что дальнейшее развитие корпоративного права должно основываться на принципах диспозитивности и свободы договора при наличии взвешенности императивных ограничений.

Обозначая дискуссионность вопроса о месте, роли норм о свободе договора в корпоративных отношениях, необходимо рассмотреть вопрос относительно ограничения принципа свободы договора в рамках реализации корпоративного договора.

Во-первых, отметим, что положения корпоративного договора направлены на регулирование только внутренних отношений, складывающихся между сторонами такого договора, и, соответственно, распространяются только на стороны такого соглашения. Однако, как отметил В.Г. Бородкин, корпоративный договор при этом может оказывать «внешний корпоративный эффект», затрагивая тем самым внешние отношения, а также интересы кредиторов организации и интересы общества. Например, такой эффект может возникать, когда идет параллельное регулирование корпоративных отношений наравне с уставом, а также при условии возможности оспаривания решений и сделок организации, принятых в противоречии с положениями корпоративного договора.

Помимо императивных норм, установленных самой ст. 67.2 ГК РФ, непосредственно касающихся регулирования корпоративного договора, своеобразными ограничениями принципа свободы договора можно назвать положения ст. 10 ГК РФ, которые устанавливают пределы осуществления гражданских прав. Эта статья содержит в себе множество весомых и существенных правил, в том числе принцип добросовестности субъектов, в соответствии с которыми резюмируется, что стороны при осуществлении своих прав и обязанностей действуют добросовестно и не допускают осуществления гражданских прав с целью причинения вреда другим лицам.